Приветствую Вас! Во-первых, не совсем ясен смысл согласия Вашей жены на приобретение данной квартиры Вашим отцом. На кого оформлена квартира? Если предположить, что Ваш отец покупал ее и остальное имущество по доверенности от Вашего имени, в Вашу собственность, и за счет Ваших денежных средств, то это будет считаться совместно нажитым имуществом и должно быть разделено. Но это в том случае, если есть доказательства, что отец приобрел  все это за Ваш счет, а не за его. В общем, чтобы не строить предположения и максимально точно ответить на Ваш вопрос, нужно уточнить все эти моменты.

По вопросу о разделе средств от продажи автомобиля – так как продажа была совершена 3 года назад, во время брака, то данные денежные средства не подлежат разделу, потому что они были потрачены на нужды семьи, к тому же срок исковой давности (3 года) уже истек. Вам лучше обратиться к юристу для правильной оценки ситуации и выбора оптимальной тактики поведения в суде.