С.с, как помещение или иное место, где действует таможенный режим С.с, может учреждаться при наличии лицензии ГТК РФ. Порядок выдачи лицензии на учреждение С.с. и срок ее действия определяются ГТК РФ по согласованию с Российским агентством международного сотрудничества и развития. За выдачу лицензии на учреждение С.с. взимается сбор в установленных размерах. Лицензия может быть аннулирована или отозвана, либо ее действие может быть приостановлено таможенными органами РФ. Лицензия аннулируется, если она не могла быть выдана на основании установленного порядка заявителю либо если она была выдана на основе неполных или недостоверных сведений, имевших существенное значение для принятия решения о ее выдаче. Лицензия отзывается, если владелец С.с. не соблюдает требований ТК РФ либо если лицензия более не соответствует экономической политике РФ. Действие лицензии может быть приостановлено на срок до 3-х месяцев при наличии оснований полагать, что владелец С.с. злоупотребляет своими правами.
Помещение или иное место, предназначенное для учреждения С.с, должно быть обустроено надлежащим образом в целях обеспечения таможенного контроля, а при необходимости - оборудовано двойными запорными устройствами, одно из которых должно находиться в ведении таможенного органа РФ. Владельцами С.с. могут быть исключительно российские лица. Владелец С.с. обязан: исключить возможность изъятия помимо таможенного контроля товаров, находящихся на складе; не затруднять осуществление таможенного контроля; соблюдать условия лицензии на учреждение С.с. и выполнять требования таможенных органов РФ, включая обеспечение доступа должностных лиц таможенных органов к товарам, находящимся на складе, предоставление этим лицам безвозмездно помещений, оборудования и средств связи на С.с. для осуществления таможенного контроля и таможенного оформления. См. также Свободная таможенная зона.