Общее руководство Д.в.ч. возлагается на командующих войсками военных округов (командующих флотами). Внутренняя и караульная службы в Д.в.ч. организуются в соответствии с Уставом внутренней службы Вооруженных Сил РФ, Уставом гарнизонной и караульной служб Вооруженных Сил РФ и Положением о дисциплинарной воинской части**.
Режим особых условий, предусмотренный УИК РФ*, в Д.в.ч. может быть введен по решению Министра обороны РФ либо командующего войсками военного округа (командующего флотом), согласованному с Главным военным прокурором или военным прокурором соответствующего военного округа (флота). В исключительных случаях время действия режима особых условий может быть продлено указанными должностными лицами. В случае возникновения непосредственной угрозы жизни и здоровью осужденных военнослужащих, лиц из числа персонала Д.в.ч. или иных лиц командир Д.в.ч. может вводить меры, предусмотренные режимом особых условий, самостоятельно с немедленным уведомлением командующего войсками военного округа (командующего флотом). В этом случае последний в течение 3 суток с момента получения уведомления принимает решение о введении режима особых условий или об отмене введенных мер. См. также Содержание в дисциплинарной воинской части.