В соответствии с Порядком присвоения статуса государственного научного центра РФ** отнесение предприятий, учреждений и организаций науки, а также вузов к Г.н.ц. РФ осуществляется Правительством РФ по представлению Межведомственной координационной комиссии по научно-технической политике. Предложения предприятий, учреждений и организаций науки, а также вузов об их отнесении к Г.н.ц. РФ вносятся в указанную комиссию заинтересованными министерствами и ведомствами после согласования с Миннауки РФ, Минэкономики РФ, Минфином РФ и Мингосимуществом РФ.
Г.н.ц. РФ действует в соответствии с законодательством и Положением об условиях государственного обеспечения центра, утверждаемым Правительством РФ одновременно с принятием решения о присвоении предприятию, учреждению, организации или вузу статуса Г.н.ц.