Средства Г.в.ф. находятся в федеральной собственности, не входят в состав бюджетов всех уровней бюджетной системы РФ и изъятию не подлежат. Расходы и доходы Г.в.ф. формируются в порядке, установленном федеральным законом, либо в ином порядке, предусмотренном БК РФ.
Правовое положение, порядок создания, деятельности и ликвидации Г.в.ф. определяются федеральным законом в соответствии с БК РФ. Согласно ст. 341 НК РФ в случаях, когда законодательством о налогах и сборах на органы Г.в.ф. возложены обязанности по налоговому контролю, эти органы пользуются правами и несут обязанности налоговых органов, предусмотренные НК РФ. Должностные лица органов Г.в.ф. несут обязанности, предусмотренные ст. 33 НК РФ. Правила, регулирующие порядок составления, представления и утверждения бюджетов Г.в.ф., доходы и расходы Г.в.ф., исполнение бюджетов указанных фондов, установлены ст. 145-150 БК РФ.