В территориальных водах какого-либо государства военные корабли продолжают пользоваться И.в.к., но должны соблюдать законы и правила прибрежного государства, а также нормы международного права, регулирующие мирный проход. И.в.к. действует и в случаях вынужденного захода во внутренние воды иностранного государства. И.в.к., находящихся в водах иностранного государства, не должен использоваться в целях, нарушающих суверенитет и территориальную неприкосновенность страны пребывания. Если военный корабль не соблюдает законы и правила прибрежного государства, регулирующие проход через территориальное море, и игнорирует любое обращенное к нему требование об их соблюдении, то прибрежное государство может потребовать, чтобы этот корабль немедленно покинул территориальные воды данного государства.
Объем льгот и привилегий, предоставляемых прибрежным государством военному кораблю, находящемуся в его территориальных водах, определяется целью посещения им портов, баз и вод данной страны (напр., официальное, неофициальное, оперативное, вынужденное посещение) и обычно включает освобождение от таможенного досмотра, а также от всех видов таможенных, санитарных, портовых и иных налогов и сборов (см.: Дипломатический словарь. Т. I. - М., 1984).